Sorge sulle fondazioni della Rocca realizzata da Baccio Pontelli (nei sotterranei, non visitabili, è tutt'ora visibile la massiccia struttura di una torre di rinfianco) e venne costruito alla fine del sec. XVI per ospitare la Magistratura cittadina costretta, nel 1585, a lasciare il Palazzo della Signoria per dar posto al Governatore Pontificio. Ristrutturato nel 1773, il palazzo ha due facciate: la principale si apre su piazza Indipendenza, l’altra, con una balconata, si apre verso piazza della Repubblica